Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF2Q01130 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms