Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSF1Q00613 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSF1Q00613 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms