Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCCQ00597 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms