Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMF1P82094 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMF1P82094 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMF1P82094 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMF1P82094 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMF1P82094 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMF1P82094 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMF1P82094 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMF1P82094 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMF1P82094 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMF1P82094 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMF1P82094 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMF1P82094 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMF1P82094 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMF1P82094 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMF1P82094 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms