Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIM1P81133 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIM1P81133 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIM1P81133 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIM1P81133 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIM1P81133 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIM1P81133 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIM1P81133 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIM1P81133 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIM1P81133 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIM1P81133 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIM1P81133 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIM1P81133 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIM1P81133 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SIM1P81133 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIM1P81133 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIM1P81133 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIM1P81133 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIM1P81133 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.7 ms