Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL8P80075 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL8P80075 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL8P80075 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL8P80075 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL8P80075 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL8P80075 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL8P80075 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL8P80075 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL8P80075 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL8P80075 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL8P80075 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL8P80075 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL8P80075 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL8P80075 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL8P80075 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL8P80075 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL8P80075 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL8P80075 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms