Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-24P63145 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK-24P63145 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms