Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms