Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GNB1P62873 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GNB1P62873 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNB1P62873 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms