Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS28P62857 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RPS28P62857 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS28P62857 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS28P62857 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms