Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCS1P62166 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCS1P62166 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCS1P62166 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCS1P62166 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCS1P62166 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCS1P62166 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCS1P62166 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NCS1P62166 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCS1P62166 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCS1P62166 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCS1P62166 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCS1P62166 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCS1P62166 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCS1P62166 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCS1P62166 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCS1P62166 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCS1P62166 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NCS1P62166 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCS1P62166 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms