Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVPABLB-1P60509 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms