Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms