Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GSDMDP57764 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GSDMDP57764 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GSDMDP57764 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GSDMDP57764 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GSDMDP57764 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GSDMDP57764 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GSDMDP57764 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSDMDP57764 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSDMDP57764 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms