Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBASH3AP57075 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms