Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BACE1P56817 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BACE1P56817 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BACE1P56817 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BACE1P56817 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BACE1P56817 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BACE1P56817 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BACE1P56817 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms