Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX10P56693 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX10P56693 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX10P56693 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX10P56693 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX10P56693 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX10P56693 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX10P56693 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX10P56693 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX10P56693 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms