Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ELLP55199 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ELLP55199 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ELLP55199 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ELLP55199 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ELLP55199 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELLP55199 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELLP55199 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELLP55199 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELLP55199 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELLP55199 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELLP55199 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELLP55199 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELLP55199 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELLP55199 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELLP55199 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELLP55199 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELLP55199 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELLP55199 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms