Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAPAP54920 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAPAP54920 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPAP54920 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPAP54920 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPAP54920 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPAP54920 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAPAP54920 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms