Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS1P54277 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS1P54277 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS1P54277 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS1P54277 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS1P54277 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMS1P54277 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS1P54277 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS1P54277 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMS1P54277 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMS1P54277 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMS1P54277 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS1P54277 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms