Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRAP54198 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRAP54198 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRAP54198 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRAP54198 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIRAP54198 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIRAP54198 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIRAP54198 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRAP54198 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRAP54198 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRAP54198 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRAP54198 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRAP54198 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRAP54198 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRAP54198 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRAP54198 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRAP54198 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRAP54198 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRAP54198 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRAP54198 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRAP54198 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRAP54198 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRAP54198 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRAP54198 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRAP54198 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRAP54198 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms