Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms