Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX2P52951 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX2P52951 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GBX2P52951 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX2P52951 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX2P52951 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GBX2P52951 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms