Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms