Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSEN1P49768 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms