Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK8P49336 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK8P49336 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK8P49336 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK8P49336 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms