Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEDD4P46934 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms