Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTHFRP42898 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTHFRP42898 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTHFRP42898 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTHFRP42898 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTHFRP42898 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTHFRP42898 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms