Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCAP37840 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCAP37840 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms