Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP62P37198 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms