Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms