Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RCVRNP35243 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCVRNP35243 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms