Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms