Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CMPK1P30085 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms