Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms