Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO1P25800 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO1P25800 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO1P25800 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMO1P25800 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO1P25800 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO1P25800 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO1P25800 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO1P25800 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO1P25800 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO1P25800 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms