Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRDP23468 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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