Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR4P22455 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms