Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD1P17405 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms