Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPGDP15428 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPGDP15428 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPGDP15428 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPGDP15428 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPGDP15428 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPGDP15428 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPGDP15428 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPGDP15428 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HPGDP15428 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HPGDP15428 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms