Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC5A1P13866 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A1P13866 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms