Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG2P13521 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG2P13521 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG2P13521 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG2P13521 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms