Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD28P10747 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD28P10747 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD28P10747 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD28P10747 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD28P10747 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD28P10747 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD28P10747 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD28P10747 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CD28P10747 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD28P10747 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD28P10747 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD28P10747 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms