Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GLI3P10071 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLI3P10071 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLI3P10071 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLI3P10071 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLI3P10071 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLI3P10071 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLI3P10071 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLI3P10071 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLI3P10071 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLI3P10071 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI3P10071 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI3P10071 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI3P10071 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI3P10071 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI3P10071 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms