Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RD3LP0DJH9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms