Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NGFRP08138 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NGFRP08138 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NGFRP08138 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NGFRP08138 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NGFRP08138 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NGFRP08138 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms