Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB1P08034 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB1P08034 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJB1P08034 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJB1P08034 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB1P08034 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms