Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms