Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV12-3P01733 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms