Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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LTAP01374 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LTAP01374 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LTAP01374 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTAP01374 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LTAP01374 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LTAP01374 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LTAP01374 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LTAP01374 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LTAP01374 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LTAP01374 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LTAP01374 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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LTAP01374 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LTAP01374 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LTAP01374 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTAP01374 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTAP01374 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTAP01374 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTAP01374 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTAP01374 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTAP01374 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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